實驗型超濾系統在電泳超濾系統開車運行幾天后，超濾系統的超濾液流量將穩定在一個流量值上，這個穩定值便是此系統的正常值，當系統的超濾液流量下降至正常值的70%時，該系統就必須進行清洗。如果延誤清洗，則會導致超濾管阻塞，使超濾液流量不可能恢復。
實驗型超濾系統維護注意事項：
1. 當超濾的進口壓力降低20%時，必須更換超濾過濾器中的精密過濾袋（過濾精度為25um）。正常運行時，旁通閥門都不能打開。
2. 主循環泵由于故障或檢修而需要停機時，此時，此時超濾加壓泵也必須停機，關閉泵的進出口閥，關閉超濾膜管漆液進出口閥和透過液閥。如果停機超過半小時，必須將膜管里的漆液排空，用純水清洗干凈，并用純水泡膜管，以保護超濾膜。
3. 過濾袋安裝好后，必須打開超濾過濾器頂部的排氣閥，先排放空氣，讓過濾器中充滿漆液，然后再將超濾加壓泵打開。
4. 更換超濾精密過濾袋前，必須用純水洗干凈、浸透。放過濾袋時要放正，不能放便，同時壓緊框也要對正，不能壓偏，緊固螺母要上緊；否則，容易漏渣，起不到較好的過濾作用，而造成后面的超濾管堵塞。
使用過程中，當實驗型超濾系統無法滿足需求時可以這樣處理：
1. 檢查超濾膜透過量，低于初始透過量的70%時應立即清洗，清洗后效果不佳時需要進行超濾膜更換；
2. 產量增加或涂裝結構復雜時，需要考慮是否增加超濾膜，提高超濾量；
3. 當系統老化或管道堵塞，需要進行更換或維修。
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